يعتبر تخصص علوم المراقبة والملاحة الجوية من التخصصات الهامة التي تعتني   بتوجيه وإدارة حركة الطيران داخل الأجواء وعلى المطارات . و يمتلك أهميته الحيوية في ضمان سلامة وكفاءة حركة الطائرات سواء في الجو أو على الأرض حيث يتضمن معرفة كافة أنظمة الملاحة الجوية و التقنيات المستخدمة للمراقبة الجوية ، و المعايير الدولية المتعلقة بالطيران وأولوياتها .

كما ويتم تدريب المنتسبين لهذا التخصص في كيفية استخدام الرادار وأنظمة الاتصالات و غيرها من التقنيات الحديثة لمراقبة وتوجيه الطائرات بأمان. و يغطي هذا التخصص أيضا مهارات أدارة الأزمات واتخاذ القرارات تحت الضغط ، كما ويتم تدريب المنتسبين لهذا التخصص على كيفية التصرف في الأحوال الجوية السيئة و الطوارئ وغيرها من الحوادث التي قد تؤثر على حركة الطائرات.

و يطرح القسم العديد من المواد ذات الاهمية الاساسية و التطبيقية في مجال علوم المراقبة والملاحة الجوية تتماشى مع التطور الهائل في مجال الاتصالات و التقنيات في هذا المجال . ومنها الملاحة المحلية والدولية ، مفاهيم أنظمة الملاحة ، انظمة الاتصالات الأرضية وغيرها الكثير. ويقوم القسم بمنح شهادة البكالوريوس في علوم المراقبة والملاحة الجوية من خلال اجتياز الطلبة لعدد الساعات المعتمدة للتخصص و عددها (134) ساعة.

الرؤية :
الريادة والتميز في  علوم المراقبة والملاحة الجوية.

الرسالة :
رفد المجتمع الأردني والعربي بكفاءات متميزة ومتخصصة ، تواكب المستجدات في مجال علوم المراقبة والملاحة الجوية وقادرة على الجمع بين النظريات والتطبيق.

الأهداف :
تتمثل أهداف القسم في كلية سلاح الجو الملكي الجامعية التقنية لعلوم الطيران فيما يلي :

• الانفراد والتميز محليا وإقليميا و دوليا والنافسة في هذا المجال.
• إعداد طيارين و مراقبين وملاحين ومسيطرين جويين وفنيين مدنيين و عسكريين مؤهلين اكاديميا و عمليا على المستوى المحلي والإقليمي.
• رفد خريجي قسم الكلية بالمهارات والخبرات والمعارف اللازمة التي تؤهلهم للعمل في وظائف متخصصة في مجالات علوم الطيران في القطاعين العسكري والمدني و تأهيلهم لاستكمال دراساتهم العليا في تخصص علوم المراقبة والملاحة الجوية.